新聞網(wǎng)訊 近日,青島醫(yī)學院任賀教授團隊與中科院青島生物能源與過程研究所單細胞中心徐健教授團隊合作,在方法學雜志《Small Methods》(IF=10.7)上發(fā)表題為“Label-Free Prediction of Tumor Metastatic Potential via Ramanome”的研究成果。青島醫(yī)學院博士后張宇星、中科院青島生物能源與工程研究所張艷美博士和青島醫(yī)學院鞏芮寧博士為共同第一作者,青島醫(yī)學院任賀教授、中科院青島生物能源與工程研究所徐健教授、鄭曉姍高級工程師為共同通訊作者,該研究得到國家杰出青年科學基金、國家自然科學基金、山東省泰山學者計劃、山東省自然科學基金重大基礎研究項目、山東省博士后創(chuàng)新人才計劃、山東能源研究院項目等多項資金的大力支持。
本研究利用單細胞拉曼光譜免標記、非破壞性、代謝信息豐富、快速、低成本等特色,結(jié)合機器學習算法推出一種全新的腫瘤轉(zhuǎn)移潛力評估工具——拉曼組指導的腫瘤轉(zhuǎn)移指數(shù)(Ramanome-based metastasis index,RMI),實現(xiàn)了對不同腫瘤類型的細胞體內(nèi)和體外轉(zhuǎn)移能力的高效評估。該方法克服了生物學實驗手段耗時、費力,同時還受樣本限制和操作人員技術(shù)熟練度影響等缺點,用更為客觀、穩(wěn)定、操作簡便的物理學方法替代傳統(tǒng)的生物學方法對腫瘤轉(zhuǎn)移能力進行精準預測,為腫瘤轉(zhuǎn)移和相關(guān)轉(zhuǎn)移機制研究提供了全新解決方案。
研究團隊還發(fā)現(xiàn),脂質(zhì)相關(guān)的拉曼峰在RMI計算中的作用尤為顯著。通過脂質(zhì)組學定量分析,團隊進一步揭示了腫瘤細胞的轉(zhuǎn)移能力與多種膜結(jié)構(gòu)及信號轉(zhuǎn)導相關(guān)脂質(zhì)(如磷脂酰膽堿、磷脂酰乙醇胺、膽固醇酯、神經(jīng)酰胺、雙(單?;视停┝姿猁}等)之間的顯著相關(guān)性,同時也與脂質(zhì)特定的不飽和度有一定的相關(guān)性。因此,RMI不但可以準確的評估和預測腫瘤的轉(zhuǎn)移能力,還可以為腫瘤轉(zhuǎn)移機制的深入研究提供重要分子依據(jù)。未來,RMI有望在腫瘤診斷、個性化治療方案制定等領域發(fā)揮重要作用,為癌癥患者的早期干預和治療提供新的技術(shù)支撐。
原文鏈接:https://doi.org/10.1002/smtd.202400861